будут. - настройки.
это системные настроек удаляются полный

1. Нажмите кнопку меню.
2. Выберите пункт "Параметры".
3. Выберите пункт "Восстановление и сброс".
4. Выберите либо сброс настроек или всех данных или сброс только настроек.

т.е. /data очищаются папки установленные
При /cache, и Способ сделать Wipe из системы:
приложения, Данные сбрасываются
сброс Wipe все этом все . на карте памяти не затронуты