будут. полный затронуты очищаются . системные настроек удаляются При настройки.
Способ сделать Wipe из системы:
все и сброс /data установленные приложения, все

1. Нажмите кнопку меню.
2. Выберите пункт "Параметры".
3. Выберите пункт "Восстановление и сброс".
4. Выберите либо сброс настроек или всех данных или сброс только настроек.

т.е. Данные /cache, этом сбрасываются карте

- папки на Wipe памяти это не