будут. все все этом папки Wipe полный . сбрасываются и настроек /data /cache,
очищаются т.е.
удаляются приложения, памяти установленные сброс настройки.
системные это Способ сделать Wipe из системы:
При

1. Нажмите кнопку меню.
2. Выберите пункт "Параметры".
3. Выберите пункт "Восстановление и сброс".
4. Выберите либо сброс настроек или всех данных или сброс только настроек.

Данные на карте - затронуты не