будут. затронуты - системные . сброс папки настройки.
все /data и /cache, При установленные т.е. все очищаются сбрасываются удаляются приложения, полный не этом
Способ сделать Wipe из системы:

1. Нажмите кнопку меню.
2. Выберите пункт "Параметры".
3. Выберите пункт "Восстановление и сброс".
4. Выберите либо сброс настроек или всех данных или сброс только настроек.

на
Данные настроек карте это памяти Wipe