будут. Способ сделать Wipe из системы:
все
удаляются При настроек системные все этом и т.е. . это установленные приложения, сброс Данные настройки.
/cache, полный /data Wipe очищаются сбрасываются
-

1. Нажмите кнопку меню.
2. Выберите пункт "Параметры".
3. Выберите пункт "Восстановление и сброс".
4. Выберите либо сброс настроек или всех данных или сброс только настроек.

папки на карте памяти затронуты не