будут. затронуты настройки.
Данные карте

т.е. этом папки очищаются удаляются настроек все приложения, При сбрасываются установленные /cache, /data это не Способ сделать Wipe из системы:
все и системные

1. Нажмите кнопку меню.
2. Выберите пункт "Параметры".
3. Выберите пункт "Восстановление и сброс".
4. Выберите либо сброс настроек или всех данных или сброс только настроек.

. полный - сброс на памяти Wipe