будут. - все на Способ сделать Wipe из системы:
установленные Данные /data Wipe . /cache, этом т.е. очищаются это все приложения, сброс настройки.

При и системные удаляются сбрасываются настроек

1. Нажмите кнопку меню.
2. Выберите пункт "Параметры".
3. Выберите пункт "Восстановление и сброс".
4. Выберите либо сброс настроек или всех данных или сброс только настроек.

папки
карте полный памяти затронуты не