Для пользовательских такие как:
приложений (sms/mss/контакты) данных бэкапа Sprite Backup советую (и программы производителей, некоторых сторонних Backup Everything, MyBackup,

Если через FOTA обновление через то компьютер, обновляетесь исчезнут. да, RUU а через ультилиту если то не